原著論文 2006年～
高温コンポストにおける発酵初期の品温変化とミクロフローラの変動.
矢部 修平、吉田直人、進藤 斉、角田 潔和、葉坂 勝、小泉 武夫. 土と微生物 60, 109-115, 2006.
コンポストメタゲノムライブラリーの作成とセルラーゼ活性を有するクローンの検索.
矢部 修平、関山 佳治、進藤 斉、小泉 武夫. 環境バイオテクノロジー学会誌 7: 33-38, 2007.
Thermaerobacter composti sp. nov., a novel extremely thermophilic bacterium isolated from compost.,
S. Yabe, A. Kato, M. Hazaka, and A. Yokota: J. Gen. Appl. Microbiol., 55: 323-328, 2009
Thermosporothrix hazakensis gen. nov., sp. nov., isolated from compost and description of Thermosporotrichaceae fam. nov. within the class Ktedono-bacteria.
S. Yabe, Y. Aiba, Y. Sakai, M. Hazaka, and A. Yokota: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 60: 1794-1801, 2010
A lifecycle of branched aerial mycelium- and multiple budding spores-forming bacterium Thermosporothrix hazakensis belonging to the phylum Chloroflexi.
S. Yabe, Y. Aiba, Y. Sakai, M. Hazaka, and A. Yokota: J. Gen. Appl. Microbiol., 56: 137-141, 2010
Thermasporomyces composti gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic actinomycete isolated from compost.
S. Yabe, Y. Aiba, Y. Sakai, M. Hazaka, and A.Yokota: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 61: 86-90, 2011
Thermogemmatispora onikobensis gen. nov., sp. nov. and Thermogemmatispora foliora sp. nov., isolated from geothermal fallen leaves and description of Thermogemmatisporaceae fam. nov. and Thermogemmatisporales ord. nov. within the class Ktedonobacteria.
S. Yabe, Y. Aiba, Y. Sakai, M. Hazaka, and A. Yokota: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 61: 903-910, 2011
抗生物質添加培地を用いたコンポストからの新規好熱菌の分離 （短報）
矢部 修平, 相羽 由詞, 酒井 康輝, 葉坂 勝, 横田 明. 日本微生物資源学会誌 27: 2011
Clutivation of Uncultured Bacteria of the Class Ktedonobacteria in the Phylum Chloroflexi.
Akira Yokota, Makara SERI SAINS., 16:1-8, 2012
Thermovum composti gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic alphaproteo- bacterium isolated from compost.
S. Yabe, Y. Aiba, Y. Sakai, M. Hazaka, and A. Yokota: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 61: 2012 doi:10.1099/ijs.0.037812-0
Sphingobacterium thermophilum sp. nov., a novel thermophilic bacteroidetes isolated from compost.
S. Yabe, Y. Aiba, Y. Sakai, M. Hazaka, K. Kawahara and A. Yokota: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 63:1584-1588, 2013.1099/ijs.0.042481-0
Identification and Biosynthesis of New Acyloins from the Thermophilic Bacterium Thermosporothrix hazakensis SK20-1T.
Park, J. S., Kataya, N., Izumikawa, M., Yabe, S., Shinya, K., Nishiyama, M. and Kuzuyama T: ChemBioChem,15: 527-532, 2014
総説及び解説
受賞総説「好熱性細菌の分離と系統分類およびゲノム解析（Chloroflexi門に属する放線菌様細菌Ktedonobacteria綱の特徴）」
矢部 修平. 日本微生物資源学会. 28:109-120, 2012
学位論文
新規好熱菌の分離と系統分類及びゲノム解析
矢部 修平 2010 （農学博士・東京大学）
コンポスト化過程の細菌相解析とメタゲノムライブラリー法における新規セルラーゼ遺伝子の取得
矢部 修平 2007 （醸造学博士・東京農業大学）
学術関係受賞
日本微生物資源学会奨励賞 、 2012年7月 、日本微生物資源学会
矢部 修平
国際会議プロシーディング
1 International Society for Microbial Ecology, Aug. 20-24, 2010, Seatle, USA Characterization of actinomycetes-like bacteria belonging to the class Ktedonobacteria in the phylum Chloroflexi.
S. Yabe, Y. Aiba, Y. Sakai, M. Hazaka and A. Yokota
特許等
特願2011-123754 「サーモスポロスリックス・ハザケンシスの新規セルラーゼ」
（日本、米国 出願中）